Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RPA4Q13156 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms