Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
NR1H3Q13133 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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