Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
TRAF3Q13114 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms