Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CHAF1AQ13111 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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