Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms