Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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GRIK3Q13003 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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