Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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