Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXO1Q12778 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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