Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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