Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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LHX9Q9NQ69 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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LHX9Q9NQ69 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
LHX9Q9NQ69 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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LHX9Q9NQ69 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LHX9Q9NQ69 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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