Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LRRC38Q5VT99 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms