Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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PTPROQ16827 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PTPROQ16827 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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