Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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DDB1Q16531 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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DDB1Q16531 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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DDB1Q16531 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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DDB1Q16531 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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DDB1Q16531 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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