Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZIC1Q15915 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms