Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
VPS72Q15906 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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