Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TAF1CQ15572 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms