Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
UBE3CQ15386 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms