Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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HERPUD1Q15011 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERPUD1Q15011 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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