Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SHPRHQ149N8 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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