Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMCO1Q147U7 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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