Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
NEDD9Q14511 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NEDD9Q14511 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.4 ms