Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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TRIM25Q14258 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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TRIM25Q14258 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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TRIM25Q14258 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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TRIM25Q14258 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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TRIM25Q14258 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRIM25Q14258 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRIM25Q14258 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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