Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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