Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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MKRN4PQ13434 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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MKRN4PQ13434 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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MKRN4PQ13434 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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MKRN4PQ13434 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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MKRN4PQ13434 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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MKRN4PQ13434 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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MKRN4PQ13434 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MKRN4PQ13434 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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