Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AP3B2Q13367 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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