Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SP140Q13342 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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SP140Q13342 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SP140Q13342 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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SP140Q13342 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SP140Q13342 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SP140Q13342 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SP140Q13342 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SP140Q13342 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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