Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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SEMA3FQ13275 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SEMA3FQ13275 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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