Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SRSF6Q13247 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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