Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2BQ13224 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms