Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PRDM2Q13029 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PRDM2Q13029 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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