Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
KCNMA1Q12791 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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KCNMA1Q12791 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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