Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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PGGT1BP53609 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP53609 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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