Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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HOXD11P31277 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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HOXD11P31277 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ZNF655-213ENST00000425063 4624 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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