Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRMP28827 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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PTPRMP28827 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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PTPRMP28827 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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