Protein–RNA interactions for Protein: O15370

SOX12, Transcription factor SOX-12, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX12O15370 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SOX12O15370 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SOX12O15370 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SOX12O15370 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
SOX12O15370 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
SOX12O15370 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SOX12O15370 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SOX12O15370 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX12O15370 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX12O15370 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX12O15370 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX12O15370 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX12O15370 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SOX12O15370 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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