Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SNPHO15079 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SNPHO15079 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNPHO15079 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNPHO15079 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNPHO15079 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNPHO15079 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNPHO15079 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNPHO15079 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SNPHO15079 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SNPHO15079 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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