Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
GDAP2Q9NXN4 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms