Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TRERF1Q96PN7 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRERF1Q96PN7 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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