Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
UBXN4Q92575 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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