Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ANKRD39Q53RE8 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms