Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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COL24A1Q17RW2 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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COL24A1Q17RW2 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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COL24A1Q17RW2 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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COL24A1Q17RW2 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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COL24A1Q17RW2 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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COL24A1Q17RW2 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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COL24A1Q17RW2 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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COL24A1Q17RW2 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
COL24A1Q17RW2 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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