Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FXNQ16595 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FXNQ16595 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FXNQ16595 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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