Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SGCBQ16585 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
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