Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
E2F4Q16254 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms