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| HERC1 | Q15751 | AL049775.2-201 | ENST00000557547 | 558 nt | TSL 4 BASIC | 0.8 | □□□□□ -2.28 | | |
| HERC1 | Q15751 | MIR3973-201 | ENST00000579824 | 107 nt | BASIC | 0.8 | □□□□□ -2.28 | | |
| HERC1 | Q15751 | AC124283.4-201 | ENST00000581815 | 456 nt | BASIC | 0.8 | □□□□□ -2.28 | | |
| HERC1 | Q15751 | AC013553.2-201 | ENST00000604244 | 589 nt | BASIC | 0.8 | □□□□□ -2.28 | | |
| HERC1 | Q15751 | IL33-205 | ENST00000611532 | 757 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0.8 | □□□□□ -2.28 | | |
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| HERC1 | Q15751 | EPGN-207 | ENST00000505212 | 285 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0.78 | □□□□□ -2.28 | | |
| HERC1 | Q15751 | AC096711.2-201 | ENST00000510592 | 454 nt | TSL 5 BASIC | 0.78 | □□□□□ -2.28 | | |
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| HERC1 | Q15751 | Y_RNA.804-201 | ENST00000615262 | 101 nt | BASIC | 0.78 | □□□□□ -2.29 | | |
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| HERC1 | Q15751 | MIRLET7G-201 | ENST00000362280 | 84 nt | BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
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| HERC1 | Q15751 | AL157938.2-201 | ENST00000587264 | 894 nt | TSL 5 BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
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| HERC1 | Q15751 | AC139103.1-201 | ENST00000534696 | 1030 nt | BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
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| HERC1 | Q15751 | CADM2-AS1-201 | ENST00000476021 | 2656 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | AL359851.1-201 | ENST00000569460 | 4997 nt | BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | AL161722.3-201 | ENST00000605789 | 2983 nt | BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | CHORDC1-206 | ENST00000529987 | 1698 nt | TSL 3 BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | LGI1-201 | ENST00000371413 | 1247 nt | TSL 1 (best) BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | FTH1P15-201 | ENST00000406984 | 280 nt | BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | AC104653.2-201 | ENST00000435407 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
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| HERC1 | Q15751 | AC104692.1-201 | ENST00000472406 | 90 nt | BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | RNU6-758P-201 | ENST00000516292 | 89 nt | BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
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| HERC1 | Q15751 | AP000560.1-201 | ENST00000624150 | 1937 nt | BASIC | 0.77 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | MIR320A-201 | ENST00000385302 | 82 nt | BASIC | 0.76 | □□□□□ -2.29 | | |
| HERC1 | Q15751 | LINC01088-203 | ENST00000507476 | 785 nt | TSL 3 BASIC | 0.76 | □□□□□ -2.29 | | |