Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HERC1Q15751 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HERC1Q15751 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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