Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRKQ15262 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRKQ15262 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRKQ15262 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRKQ15262 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRKQ15262 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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PTPRKQ15262 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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PTPRKQ15262 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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