Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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HERPUD1Q15011 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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HERPUD1Q15011 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERPUD1Q15011 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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