Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SHPRHQ149N8 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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SHPRHQ149N8 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SHPRHQ149N8 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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