Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CDK13Q14004 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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