Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CACNA1CQ13936 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1CQ13936 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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